OnSiteSeq
AI medtech платформа для управления контейнеризованными биоинформатическими пайплайнами. Определение лекарственной устойчивости, субтипа патогена и многое другое. Работа по стандартам GxP, GLP, ALCOA+.
Описание компонентов
-
OnSiteSeq Edge
Автономный программно-аппаратный комплекс. Секвенирование у кровати пациента, в регионах крайнего севера и на выезде. Архитектура arm64, GPU Nvidia Jetson AGX.
-
OnSiteSeq Desktop
Система управления пайплайнами Cockpit для рабочего компьютера врача или исследователя. Работает автономно или в паре с Edge. Архитектура x86.
-
OnSiteSeq Cloud
Версия Cockpit для запуска в облачных провайдерах. Доступна по адресу cloud.onsiteseq.io. Архитектура x86.
Реализованные пейплайны
Пейплайны в работе. Помощники врача.
-
Клостридии (C. difficile)
Определение лекарственной устойчивости и токсигенности Clostridioides difficile — возбудитель антибиотик-ассоциированного колита
-
Гонорея (N. gonorrhoeae)
Определение лекарственной устойчивости Neisseria gonorrhoeae — приоритетный патоген ВОЗ по АМР
-
Коронавирус SARS-COV-2
Определение варианта (субтипа) и устойчивости к противовирусным препаратам
-
Золотистый стафилококк (S. aureus)
Определение MRSA/VRSA и полного профиля AMR Staphylococcus aureus — ведущего возбудителя нозокомиальных инфекций
-
ОРВИ (вирусные возбудители)
Метагеномная идентификация вирусных возбудителей ОРВИ — грипп A/B, RSV, риновирус, коронавирусы, аденовирус и др.
-
ОРЗ (бактериальные возбудители)
Метагеномная идентификация бактериальных возбудителей ОРЗ и их устойчивости к антибиотикам — S. pneumoniae, H. influenzae, K. pneumoniae и др.
Пейплайны в работе. Помощники фермера и криминалиста.
-
Портрет преступника по ДНК
Предсказание внешности, происхождения и возраста по ДНК с места преступления — Forensic DNA Phenotyping на основе нанопорового секвенирования
-
Фитофтороз и патогены растений
Метагеномная идентификация патогенов растений и устойчивости к фунгицидам — P. infestans, Fusarium, Botrytis и др. Прямо в поле.