На главную
О комплексе. Программная и аппаратная часть
Roman Gorbenko / February 2025 (78 Words, 1 Minutes)
О комплексе OnSiteSeq
Ниже представлено описание основных программных компонентов комплекса с пояснением какие шаги по доработке и импортозамещению были выполнены в рамках данного проекта.
Программная часть
1. Система управления данными
- PostgreSQL - основная СУБД для хранения результатов анализов
- Redis - кэширование и управление сессиями
- MinIO - объектное хранилище для файлов секвенирования
2. Аналитические модули
- Snakemake - оркестрация биоинформатических пайплайнов
- R/Bioconductor - статистический анализ данных
- Python - машинное обучение и ИИ-анализ
- CUDA - GPU-ускорение вычислений
3. Пользовательский интерфейс
- React - веб-интерфейс для врачей
- Vue.js - мобильное приложение для полевых работ
- REST API - интеграция с медицинскими системами
Аппаратная часть
1. Секвенатор
- Oxford Nanopore MinION - портативное устройство секвенирования
- Модифицированная проточная ячейка - оптимизация для клинических образцов
- Система контроля качества - автоматическая валидация данных
2. Вычислительный модуль
- NVIDIA GPU - ускорение биоинформатических алгоритмов
- ARM процессор - энергоэффективная обработка данных
- SSD накопитель - быстрый доступ к данным
3. Полевое оборудование
- Портативная лаборатория - компактная установка для полевых условий
- Система подготовки проб - автоматизация рутинных операций
- Контроль температуры - поддержание оптимальных условий
Интеграция и стандарты
1. Медицинские стандарты
- HL7 FHIR - обмен медицинскими данными
- DICOM - работа с медицинскими изображениями
- GxP - соответствие фармацевтическим стандартам
2. Безопасность
- Шифрование данных - защита персональной информации
- Аудит доступа - контроль действий пользователей
- Резервное копирование - надежность хранения данных
3. Масштабируемость
- Микросервисная архитектура - гибкость развертывания
- Контейнеризация - простота обновлений
- Облачные решения - возможность масштабирования
© 2026 Роман Горбенко, МФТИ-стартап "OnSiteSeq - Секвенирование на месте (у кровати / у стола / в поле)"