Конференция МФТИ-2026

Определение резистентности и субтипов ВИЧ-1 с применением глубокого обучения на ПАК OnSiteSeq

🎤 О выступлении

Команда OnSiteSeq представила программно-аппаратный комплекс для обработки данных секвенирования третьего поколения в клинической диагностике ВИЧ-1.

Докладчик: Роман Горбенко (МФТИ)
Секция: ФБМФ — Секция биоинформатики и системной биологии
Дата выступления: 30 марта 2026 г.
Страница доклада: Официальный сайт конференции МФТИ

📄 Аннотация исследования

В рамках доклада была продемонстрирована реализация полного цикла (End-to-End) обработки данных нанопорового секвенирования. Комплекс решает фундаментальные задачи: высокоточную классификацию специфичных для РФ субтипов вируса (A6, CRF63_02A6) и прогнозирование лекарственной устойчивости.

Ключевые технологии и достижения:

Гибридные нейросети: Применение архитектуры ID-CNN + Self-Attention для эффективного моделирования эпистаза.
Технологический суверенитет: Графический интерфейс (GUI) позволяет анализировать сырые данные с секвенатора напрямую, исключая необходимость передачи медицинских данных на зарубежные серверы.
Автоматизация отчётов: Генерация интерпретируемых клинических отчётов для врачей и детальных QC-метрик для биоинформатиков.

📥 Скачать полные тезисы (PDF) 📥 Скачать презентацию доклада (PDF)

📸 С места событий

Представление результатов ПАК OnSiteSeq на секции ФБМФ