Международная конференция МСИТ-2026

Презентация концепции BioMLOps на примере системы предсказания резистентности ВИЧ-1


🎤 О выступлении

Команда OnSiteSeq приняла активное участие в конференции МСИТ-2026. Мы представили наш подход к управлению жизненным циклом моделей машинного обучения в строгих условиях биомедицинских разработок.

  • Докладчик: Роман Горбенко (МФТИ)
  • Тема доклада: «Методология управления жизненным циклом машинно-обучаемых моделей в биомедицинских приложениях: исследование на данных о резистентности ВИЧ-1»
  • Официальное видео: Посмотреть репортаж организаторов (VK Видео)

📄 Аннотация исследования

В нашей работе мы впервые предложили концепцию BioMLOps — адаптацию передовых методологий MLOps специально для задач вычислительной биологии. Эффективность подхода была продемонстрирована на примере создания HIV-1-Resist-Rus, системы прогнозирования лекарственной устойчивости ВИЧ-1.

Ключевые достижения, отмеченные в докладе:

  • Обеспечена полная управляемость жизненного цикла моделей: от выбора архитектуры нейросети до непрерывного мониторинга метрик (Validation Loss, Accuracy).
  • Разработан инструмент для автоматического версионирования экспериментов с сохранением метрик (включая F1-score) для регрессионного тестирования.
  • Реализован автоматический пайплайн дообучения при обновлении внешних баз данных (включая Stanford HIVDB) с системой детекции деградации качества модели (model degradation).

📥 Скачать полные тезисы доклада (PDF)


📸 Галерея

Атмосфера конференции и презентация нашего решения:


💡 Open Source инициатива: > Исходный код для конференции (https://gitverse.ru/onsiteseq/).

© 2026 Роман Горбенко, МФТИ-стартап "OnSiteSeq - Секвенирование на месте (у кровати / у стола / в поле)"