Конференция МНСК-2026

Классификация доминирующих в РФ субтипов ВИЧ-1 с применением методов глубокого обучения


🎤 О выступлении

Команда OnSiteSeq приняла участие в Международной научной студенческой конференции (МНСК), представив решение для точного определения субтипов ВИЧ-1, адаптированное под уникальную эпидемиологическую ситуацию в России.

  • Докладчик: Роман Горбенко (МФТИ)
  • Научные руководители: Н.С. Радченко, Д.Е. Киреев (к.б.н.)
  • Событие: МНСК-2026

📄 Аннотация исследования

Пандемия подчеркнула необходимость глобального усиления геномного эпидемиологического надзора. В контексте ВИЧ-1 зарубежные алгоритмы (в том числе разработанные в США) часто не учитывают специфику распространения вируса в Российской Федерации, где эпидемия носит выраженный монофилетический характер.

Ключевые тезисы работы:

  • Специфика РФ: Доминирующим вариантом ВИЧ-1 в России является субтип A6, на который приходится 83.14% от всех зарегистрированных случаев инфекции.
  • Проблема существующих решений: Стандартные инструменты на основе машинного обучения, обученные на западных базах данных, не показывают достаточной эффективности при анализе российских штаммов.
  • Наше решение: Применение передовых архитектур глубокого обучения (Deep Learning) для создания отечественного алгоритма. Он обеспечивает высокую точность распознавания целевых субтипов и их рекомбинантных форм, циркулирующих на территории России.

📥 Скачать полные тезисы (PDF)


📸 С места событий

Презентация OnSiteSeq на МНСК-2026

МНСК-2026

© 2026 Роман Горбенко, МФТИ-стартап "OnSiteSeq - Секвенирование на месте (у кровати / у стола / в поле)"